Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VhlP40338 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VhlP40338 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VhlP40338 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms