Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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