Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Saa4P31532 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms