Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms