Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxc10P31257 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc10P31257 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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