Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms