Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Kif5cP28738 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kif5cP28738 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms