Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RxraP28700 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RxraP28700 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RxraP28700 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RxraP28700 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RxraP28700 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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