Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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