Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12P23812 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms