Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ggta1P23336 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ggta1P23336 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ggta1P23336 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ggta1P23336 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ggta1P23336 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ggta1P23336 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms