Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms