Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RarbP22605 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RarbP22605 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RarbP22605 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RarbP22605 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RarbP22605 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RarbP22605 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RarbP22605 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms