Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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