Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TP20293 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TP20293 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TP20293 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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