Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18529 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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P18529 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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P18529 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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P18529 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18529 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P18529 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms