Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Hoxb1P17919 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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