Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms