Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra6P16305 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms