Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim30aP15533 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim30aP15533 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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