Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms