Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nr4a1P12813 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms