Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lire1P11260 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lire1P11260 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms