Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl2P10148 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms