Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtaP09225 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtaP09225 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtaP09225 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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