Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04945 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04945 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04945 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04945 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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