Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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