Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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