Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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