Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms