Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cited2O35740 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms