Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
E2f3O35261 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms