Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SdcbpO08992 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SdcbpO08992 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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