Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hps1O08983 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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