Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms