Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5458L7N219 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms