Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms