Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8888J3QPX5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms