Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms