Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms