Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms