Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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