Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc180J3QNE4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc180J3QNE4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms