Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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