Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vmn1r167G3UW71 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms