Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3371F7CQW8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms