Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms