Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd1E9PZ26 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms