Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms