Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MccE9PWI3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms